MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 plasmid pEC4115

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011351	GTT	2	6	8	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011351	TTTA	2	8	14	21	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011351	ATT	2	6	66	71	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011351	T	6	6	1110	1115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011351	TAA	2	6	1126	1131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011351	CCG	2	6	1170	1175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_011351	CGG	2	6	1185	1190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011351	AGG	2	6	1216	1221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011351	CCA	2	6	1502	1507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_011351	GGC	2	6	1524	1529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011351	T	7	7	1540	1546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011351	A	6	6	1562	1567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011351	A	8	8	1593	1600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011351	TAA	2	6	1610	1615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011351	AGG	2	6	2076	2081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011351	GGA	2	6	2090	2095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011351	ATGTAA	2	12	2177	2188	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011351	TTA	2	6	8054	8059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011351	TCTT	2	8	8068	8075	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011351	TGAAT	2	10	8122	8131	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011351	ACA	2	6	8132	8137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011351	TGA	2	6	14241	14246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011351	TCA	2	6	16152	16157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011351	AAC	2	6	16206	16211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011351	T	6	6	16228	16233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011351	TAA	2	6	16236	16241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011351	ATA	2	6	16867	16872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011351	ATT	2	6	19041	19046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011351	GGT	2	6	19101	19106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011351	GTTG	2	8	19470	19477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011351	TA	3	6	19513	19518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011351	TGTT	2	8	19573	19580	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011351	AT	3	6	19624	19629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011351	TAA	2	6	19638	19643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011351	GA	3	6	19700	19705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011351	TC	3	6	20011	20016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011351	A	6	6	20062	20067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011351	T	6	6	20087	20092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011351	TGG	2	6	20112	20117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011351	GTG	2	6	20212	20217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011351	TCAG	2	8	20244	20251	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011351	CTGG	2	8	20318	20325	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011351	GGT	2	6	20333	20338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011351	AGG	3	9	20359	20367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011351	GA	3	6	20389	20394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011351	TCC	2	6	20435	20440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_011351	GAT	2	6	20459	20464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011351	ATC	2	6	20475	20480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011351	TGA	2	6	20553	20558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011351	A	7	7	20627	20633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011351	CGG	2	6	20699	20704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011351	TTG	2	6	20715	20720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011351	CAGC	2	8	20766	20773	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011351	CTT	2	6	20808	20813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011351	CGC	2	6	20815	20820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_011351	ATTGT	2	10	20826	20835	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011351	ACAAT	2	10	20836	20845	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_011351	A	6	6	20897	20902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011351	GCA	2	6	20929	20934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011351	T	7	7	20944	20950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011351	TGC	2	6	20973	20978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011351	ACT	2	6	21084	21089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011351	GCA	2	6	21151	21156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011351	A	7	7	21172	21178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011351	GTG	2	6	21183	21188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011351	A	6	6	21213	21218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011351	AGG	2	6	21259	21264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011351	TAT	2	6	21295	21300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011351	GTG	2	6	21303	21308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011351	ATT	2	6	21386	21391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011351	TGA	2	6	21421	21426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011351	TTA	2	6	21462	21467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011351	ATA	2	6	21510	21515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011351	CAA	2	6	21567	21572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011351	TG	4	8	21649	21656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011351	TAA	2	6	21685	21690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011351	ATT	2	6	21692	21697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011351	A	7	7	22404	22410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011351	ATC	2	6	22463	22468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011351	TAT	2	6	22613	22618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011351	AATT	2	8	22625	22632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011351	GGT	2	6	22640	22645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011351	CCTTA	2	10	22734	22743	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_011351	CTG	2	6	22786	22791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011351	T	7	7	22860	22866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011351	A	7	7	23158	23164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011351	TAA	2	6	24008	24013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011351	AC	3	6	24015	24020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011351	TCA	2	6	24061	24066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011351	AC	3	6	24087	24092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_011351	TAT	2	6	24780	24785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011351	AC	3	6	24787	24792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_011351	GT	3	6	25440	25445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011351	AC	3	6	25452	25457	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011351	AC	3	6	25794	25799	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_011351	CTTT	2	8	26452	26459	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011351	ACG	2	6	30068	30073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011351	T	6	6	30120	30125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011351	AC	3	6	30145	30150	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_011351	AC	4	8	30157	30164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_011351	CAC	2	6	30170	30175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_011351	AC	3	6	30178	30183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_011351	CA	3	6	30191	30196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_011351	AC	4	8	30202	30209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_011351	CA	3	6	30215	30220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_011351	A	6	6	30220	30225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011351	ACA	2	6	30231	30236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011351	CA	3	6	30235	30240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011351	AC	4	8	30246	30253	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011351	CA	3	6	30259	30264	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_011351	AC	4	8	30270	30277	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011351	AT	3	6	30317	30322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011351	CGG	2	6	32696	32701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011351	TCC	2	6	32891	32896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_011351	AC	4	8	32916	32923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_011351	AC	3	6	32926	32931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011351	A	6	6	32938	32943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011351	A	6	6	32983	32988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011351	GCG	2	6	33033	33038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011351	A	7	7	33046	33052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011351	ATG	2	6	33056	33061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011351	A	7	7	33075	33081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011351	G	6	6	33082	33087	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011351	AAT	2	6	33090	33095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011351	C	6	6	33098	33103	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
126	NC_011351	C	7	7	33303	33309	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
127	NC_011351	A	7	7	33310	33316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011351	A	6	6	34098	34103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011351	CAG	2	6	34277	34282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011351	GCA	2	6	34362	34367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011351	GGGCG	2	10	34368	34377	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
132	NC_011351	CAA	2	6	34414	34419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011351	TAT	2	6	35275	35280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011351	TCC	2	6	35518	35523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_011351	G	6	6	35530	35535	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011351	C	6	6	35539	35544	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
137	NC_011351	A	6	6	35994	35999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011351	CAG	2	6	36173	36178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011351	GCA	2	6	36258	36263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011351	GGGCG	2	10	36264	36273	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
141	NC_011351	GGT	2	6	36429	36434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011351	AATG	2	8	36489	36496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011351	CGA	2	6	36505	36510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_011351	GT	3	6	36518	36523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011351	AAG	2	6	36562	36567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011351	CCA	2	6	36604	36609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_011351	T	6	6	37033	37038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011351	GTTTT	2	10	37039	37048	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011351	ACTT	2	8	37182	37189	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_011351	TAAG	2	8	37207	37214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011351	T	6	6	37230	37235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.